Les symptômes neurologiques de l’EMAD sont nombreux : faiblesse motrice, troubles de la sensibilité, troubles urinaires ou du transit intestinal, problèmes d’équilibre et de coordination, baisse de la vision… Les patients touchés par cette maladie peuvent également présenter des troubles du comportement, de l’humeur, de la mémoire, et/ou de la concentration, ainsi qu’une altération de la conscience (encéphalopathie pouvant aller jusqu’au coma), des céphalées, et des crises d’épilepsie. Ces symptômes s’aggravent au bout de 4 à 7 jours et peuvent durer plusieurs semaines. Les enfants présentant une EMAD ont souvent de la fièvre.
La sévérité de cette maladie est variable ; une admission en service de réanimation peut être nécessaire.